Detta kapitel fokuserar på genetisk heterogenitet och komplementering. Den mest användbara teknik som för närvarande finns tillgänglig för att avgränsa den genetiska grunden för en metabolisk sjukdom är komplementeringstestet. Det kräver att man för samman den defekta genen hos varje mutant i samma cell och testar om funktionen återställs. En normal fenotyp bör uppstå om varje mutant kan tillföra det som är bristfälligt hos den andra. Detta kommer att vara fallet för mutationer i olika gener – intergenisk komplementering – och i sällsynta fall för olika mutationer i samma gen – intragenisk komplementering. Att den muterade fenotypen bibehålls är a priori ett bevis för att mutationerna har inträffat på samma genetiska locus, eftersom inget av föräldragenomenen kan korrigera felet hos det andra. Dessa punkter gäller endast för recessiva mutationer, eftersom en dominant mutation inte skulle tillåta uttryck av den normala allelen i ett komplementeringstest. De flesta komplementationsstudier av metabola sjukdomar hos människor har gjorts i fibroblast-heterokaryoner.