Mutationer i antistoffers rammeområder forekommer i celler ved somatisk hypermutation og under affinitetsmodning af antistoffet. In vitro kan mutationer i FR forekomme af naturlig årsag eller ved udsættelse for mutagener. Nylige undersøgelser af ramme-mutationer tyder på, at rammeområdets fleksibilitet eller stivhed kan ændre antistoffets specificitet i forhold til den tilsigtede epitop. Selv om rammeområdet ikke interagerer direkte med antigenet, er dets struktur afgørende for, om CDR’erne kan interagere med antigenet. Hvis CDR-regionerne har høj affinitet for antigenets epitop, har det vist sig at være mere effektivt at have en mere stiv ramme region. Når CDR ikke har høj affinitet for antigen, kan mutationer i FR, der skaber en mere fleksibel struktur, muliggøre en højere affinitetsmodning.
Naturlige mutationer i den variable region skyldes typisk aktiveringsinduceret cytidindeaminase (AID). AID fører til deaminering af cytosin til uracil i DNA og resulterer i somatisk hypermutation. Denne somatiske hypermutation giver mulighed for at skifte immunoglobulinklasse, men resulterer også i affinitetsmodning af antistoffet. CDR-områderne er de områder af de variable regioner, der er i kontakt med antigenet, og det er derfor i disse regioner, at vi ser flest mutationer. Selv om antistoffets rammeområder også er muteret. Undersøgelser har vist, at når CDR’en er blokeret for mutationer, og kun FR’en er muteret, kan visse mutationer føre til øget ekspression og termostabilitet af antistoffet som helhed. humanisering af antistoffer er et eksempel på gavnlig genteknologi inden for medicin i dag. Humaniseret antistof henviser til skabelsen af ikke-menneskelige antistoffer in vivo og som reaktion på antigen, derefter isolering og humanisering af ramme- og konstante regioner. Det er blevet opdaget, at selv om disse antistoffer forbliver relativt intakte ved overgangen, kan disse modifikationer også føre til nedsat bindingsaffinitet i de humaniserede rammeområder og resultere i ukorrekt foldning hos mennesker. Denne observation menes at skyldes rammegruppens rolle i antistofstrukturen.