DNA absorbiert UV-Licht mit einer Wellenlänge der maximalen Absorption bei 260 nm. Diese Absorption ist auf die pi-Elektronen in den aromatischen Basen der DNS zurückzuführen. In dsDNA oder sogar in Bereichen der RNA, in denen eine Doppelstrangstruktur vorliegt, sind die Basen parallel zueinander gestapelt, und die Überlappung der Basenmolekülorbitale führt zu einer Abnahme der Absorption von UV-Licht. Dieses Phänomen wird als hypochromer Effekt bezeichnet. Wenn DNAse Nukleotide aus dsDNA freisetzt, sind die Basen nicht mehr so gestapelt wie in dsDNA, so dass die Überlappung der Orbitale minimiert wird und die UV-Absorption zunimmt. Dieser Anstieg der Absorption ist die Grundlage für die Kunitz-Einheit der DNAse-Aktivität. Eine Kunitz-Einheit ist definiert als die Menge an Enzym, die zu 1 mg/ml Lachssperma-DNA zugegeben wird und die einen Anstieg der Absorption von 0,001 pro Minute bei einer Wellenlänge von 260 nm bewirkt, wenn sie auf hochpolymerisierte DNA bei 25 °C in einem 0,1 M NaOAc (pH 5,0)-Puffer einwirkt. Der Name des Geräts geht auf den russisch-amerikanischen Biochemiker M. Kunitz zurück, der den Standardtest 1946 vorschlug.

Ein Standard-Enzympräparat sollte parallel zu einem unbekannten durchgeführt werden, da eine Standardisierung von DNA-Präparaten und deren Polymerisationsgrad in Lösung nicht möglich ist.

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