”Löytöluut”, jotka johtivat Carnegie Quarryn löytämiseen, olivat Apatosaurus louisaen häntänikamia (selkänikamia). Tästä näytteestä, lähes täydellisestä luurangosta ja kallosta, tuli Apatosaurus louisae -lajin tyyppinäyte. Tämä tarkoittaa, että se oli lajinsa ensimmäinen koskaan löydetty ja tieteellisesti kuvattu.
Kuten monet sauropodit ja dinosaurukset yleensä, Apatosauruksen kallot ovat äärimmäisen harvinaisia. Kallon luut ovat ohuita ja helposti murskautuvia. Kallot ovat enimmäkseen onttoja pitääkseen sisällään pehmytkudoksia, joita ei voida säilyttää. Hienojakoiset sedimentit puristavat kalloa ja litistävät sitä samaan tapaan kuin tyhjän säilyketölkin päälle voi astua. Nämä kallot voivat säilyä, mutta osa kolmiulotteisesta rakenteesta on kadonnut.
Maailman ainoa Apatosauruksen kallo löydettiin Carnegien louhoksesta, koska hiekan kokoinen sedimentti säilyttää luun hyvin yksityiskohtaisesti sitä puristamatta. Nykyään Apatosauruksen kallon valukappale on edelleen esillä muun yksilön kanssa Carnegie Museum of Natural History -museossa Pittsburghissa, Pennsylvaniassa. Oikea kallo ei ole esillä luun haurauden vuoksi.