Nur ein einziger Apatosaurus-Schädel wurde jemals gefunden, und der stammt aus dem Dinosaur National Monument.

Die „Entdeckungsknochen“, die zur Entdeckung des Carnegie-Steinbruchs führten, waren Schwanzwirbel (Rückenknochen) von Apatosaurus louisae. Dieses Exemplar, ein fast vollständiges Skelett mit einem Schädel, wurde zum Typusexemplar von Apatosaurus louisae. Das bedeutet, dass es das erste seiner Art war, das jemals gefunden und wissenschaftlich beschrieben wurde.

Wie bei vielen Sauropoden und Dinosauriern im Allgemeinen sind Apatosaurus-Schädel extrem selten. Die Schädelknochen sind dünn und leicht zu zertrümmern. Die Schädel sind meist hohl, um Weichteile aufzunehmen, die nicht erhalten werden können. Feine Sedimente drücken den Schädel zusammen und machen ihn so flach, wie man auf eine leere Konservendose treten würde. Diese Schädel können zwar erhalten bleiben, aber ein Teil der dreidimensionalen Struktur geht verloren.

Der einzige Apatosaurus-Schädel der Welt wurde im Carnegie-Steinbruch gefunden, weil das sandige Sediment die Knochen bis ins Detail erhält, ohne sie zu komprimieren. Heute ist ein Abguss des Apatosaurus-Schädels zusammen mit dem Rest des Exemplars im Carnegie Museum of Natural History in Pittsburgh, Pennsylvania, ausgestellt. Der echte Schädel ist aufgrund der Zerbrechlichkeit des Knochens nicht ausgestellt.

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