Leir blev født i San Francisco Bay-området i 1935. Han flyttede til det sydlige Californien, da han var 13 år gammel. Han beskrev sin barndoms fantasi som “vild og livlig” og fantaserede ofte om, at han var i stand til at flyve. Han gik på University of Southern California og blev færdig med en bachelorgrad i naturvidenskab i 1961. I 1964 blev han uddannet som fodterapeut og blev senere involveret i den lokale afdeling af Mutual UFO Network (MUFON).
På en MUFON-konference i 1995 undersøgte Leir røntgenbilleder fra en kvinde, der troede, at hun var blevet bortført. Han udtog senere to små metalliske fremmedlegemer fra hende, og også fra en anden patient. Genstandene blev analyseret af New Mexico Institute of Mining and Technology, som fastslog, at de var “sammensat af almindeligt forekommende grundstoffer”, såsom jern eller aluminium. Ved beskrivelsen af nogle af disse elementer henviste laboratorierapporten til sammensætningen af meteorer. Leir fortolkede dette som om, at de genstande, der blev fjernet fra hans patienter, var “af extraterrestrisk oprindelse”. Han kom til at tro, at genstandene var anordninger, der var implanteret af rumvæsener, og “videnskabelige beviser på ikke-jordiske eksperimenter med mennesker”. Leir blev hurtigt fremtrædende inden for rumvæsensbortførelser og UFO-samfund. Han hyrede en tandlæge, en radiolog og en kirurg til at bistå ham i sin praksis. Leir hævdede, at de genstande, han fjernede fra patienterne, udsendte “radiobølger med deep space-frekvenser”, havde mærkelige magnetiske egenskaber eller indeholdt mærkelige krystallinske strukturer. Ifølge den skeptiske efterforsker Joe Nickell var de “implantater”, som Leir hævdede at have fundet, højst sandsynligt almindelige genstande som f.eks. glasskår eller metalstykker, der sætter sig fast i arme, hænder, ben og fødder som følge af uheldige fald eller barfodsløb. Da Leirs samarbejdspartner, Derrel Sims, blev bedt om at give et retsmedicinsk institut prøver eller fotos til analyse, nægtede han.
Leir skrev The Aliens and the Scalpel i 1999, hvor han beskrev sin “implantat”-operation. Hans næste bog, Casebook: Alien Implants, blev udgivet i 2000. Han begyndte at optræde i forskellige radio- og tv-shows og talte på UFO-konferencer. I 2001 rapporterede en journalist, der besøgte hans kontor i Ventura i Californien, at det indeholdt UFO-magasiner og en hylde fuld af “insektøjede alien-dukker”. I 2003 rejste han til Varginha i Brasilien for at undersøge det påståede nedstyrtning af et rumskib med rumvæsener og producerede i 2005 en bog med titlen UFO Crash in Brazil.
Dr. Leir skrev “The Smoking Gun”-artiklen til Un-X News Magazine, som blev offentliggjort den 2. marts 2014, blot få dage før hans død. Leir fortalte udgiveren, at det var den mest detaljerede artikel, han havde skrevet til dato.