Fysiografia
Itä-Kiinan meri on pinta-alaltaan noin 750 000 neliökilometriä (290 000 neliömailia), ja se on suurelta osin matalaa; lähes kolme neljäsosaa merestä on alle 200 metriä (650 jalkaa) syvää, ja sen keskisyvyys on vain 350 metriä (1 145 jalkaa). Ryukyu-saarten varrella on syvempi osa, Okinawan kaukalo, jonka suuri osa on yli 1 000 metriä (3 300 jalkaa) syvä ja jonka suurin syvyys on 2 716 metriä (8 912 jalkaa). Meren länsireuna on jatkoa Etelä-Kiinanmeren ja Keltaisenmeren väliselle hyllylle. Itärajalla sekä Kiinan mantereen läheisyydessä olevalla alueella on suuri määrä saaria ja karikoita.
Matalat hyllyalueet ovat peittyneet rajanaapurina olevien maamassojen sedimentteihin, jotka ovat laskeutuneet pääasiassa Jangtsen ja muiden jokien laskeuttamina lähellä meren pohjoisosaa. Kauempana esiintyy karkeampia hiekkasedimenttejä, ja hajallaan on myös kiviä, mutaa ja tihkua. Seisminen profilointi osoittaa, että merenpohjan alla oleva geologinen rakenne koostuu lähes samansuuntaisista poimuista, joissa on kallioharjanteita lähellä Itä-Kiinan meren pohjoisrajaa, lähellä mannerjalustan reunaa ja Ryukyus-saarten varrella. Nämä ovat muodostaneet esteitä suuren Huang He -joen (Keltainen joki) ja myös Jangtse-joen mukanaan tuomille sedimenteille. Harjujen välissä sedimentti on jopa kilometrin paksuista.
Suurin osa mannerjalustasta kuuluu vakaaseen Neo-Cathaysian geosynkliiniin (tai Cathaysian Platformiin), joka on syntynyt ainakin 300 miljoonaa vuotta sitten. Okinawan kaukalo on ehkä 10 miljoonaa vuotta vanha. Ryukyukset ovat saariketju, jonka Itä-Kiinanmeren puolella on useita tuliperäisiä saaria. Monet tulivuorista ovat edelleen aktiivisia. Maanjäristysten epikeskukset sijaitsevat Okinawan kaukalon ja Ryukyu-saarten kaaren akselilla.