Vliv na mozek
Předpokládá se, že problém s chromozomem 15 narušuje normální vývoj a fungování části mozku zvané hypotalamus.
Hypotalamus hraje roli v mnoha funkcích těla, například produkuje hormony a pomáhá regulovat chuť k jídlu. Špatná funkce hypotalamu může vysvětlovat některé typické znaky Prader-Williho syndromu, jako je opožděný růst a přetrvávající hlad.
Studie využívající pokročilou technologii zobrazování mozku ukázaly, že po jídle mají lidé s Prader-Williho syndromem velmi vysokou úroveň elektrické aktivity v části mozku zvané frontální kůra. Tato část mozku je spojena s fyzickým potěšením a pocity spokojenosti.
Možná je, že lidé s Prader-Williho syndromem považují akt jídla za nesmírně uspokojující, podobně jako drogový opojení, a neustále vyhledávají jídlo, aby tohoto opojení dosáhli.
Jinou teorií je, že u Prader-Williho syndromu nedokáže hypotalamus posoudit hladinu potravy v těle tak dobře jako obvykle. To znamená, že člověk s tímto syndromem má vždy pocit hladu bez ohledu na to, kolik jídla sní.