Vaikutus aivoihin
Voidaan ajatella, että ongelma kromosomissa 15 häiritsee aivojen hypotalamukseksi kutsutun osan normaalia kehitystä ja toimintaa.
Hypotalamuksella on rooli monissa elimistön toiminnoissa, kuten hormonien tuottamisessa ja ruokahalun säätelyssä. Hypotalamuksen toimintahäiriö saattaa selittää joitakin Prader-Willin oireyhtymälle tyypillisiä piirteitä, kuten viivästynyttä kasvua ja jatkuvaa nälkää.
Tutkimukset, joissa on käytetty kehittynyttä aivojen kuvantamistekniikkaa, ovat osoittaneet, että syömisen jälkeen Prader-Willin oireyhtymää sairastavilla henkilöillä on erittäin korkea sähköinen aktiivisuus aivojen otsalohkoksi kutsutussa osassa. Tämä aivojen osa liittyy fyysiseen mielihyvään ja tyytyväisyyden tunteisiin.
Voi olla mahdollista, että ihmiset, joilla on Prader-Willin oireyhtymä, kokevat syömisen äärimmäisen palkitsevana, aivan kuin huumeiden aiheuttaman huuman, ja etsivät jatkuvasti ruokaa saavuttaakseen tuon huuman.
Toinen teoria on, että Prader-Willin oireyhtymässä hypotalamus ei pysty arvioimaan ruoan määrää elimistössä niin hyvin kuin tavallisesti tekee. Tämä tarkoittaa sitä, että oireyhtymää sairastava henkilö tuntee aina nälkää riippumatta siitä, kuinka paljon ruokaa hän syö.