I den levande organismen produceras proteolytiska enzymer (proteaser) för att bryta ner och modifiera proteiner. En huvuduppgift för proteolytiska enzymer är att bryta ner proteiner till peptider eller aminosyror som kan användas antingen som energikälla eller som byggstenar för nysyntes av proteiner. Vidare modifierar proteolytiska enzymer cellmiljöer och underlättar cellmigration i samband med sårläkning och cancer, ägglossning och inplantering av det befruktade ägget, embryonal morfogenes och involution av mjölkkörtlar efter amning.
En annan viktig funktion för proteaserna är deras roll som reglerare i processer som inflammation, infektion och blodkoagulering. De flesta proteolytiska enzymer är mycket specifika för sina substrat. Klassificeringen av proteaser baseras dock inte på deras val av substrat utan på deras verkningsmekanism.
Fyra olika grupper av proteolytiska enzymer, namngivna efter den aminosyrarest på den aktiva platsen som ansvarar för den katalytiska aktiviteten, särskiljs i allmänhet: de aspartiska proteaserna (t.ex. pepsin), cysteinproteaserna (t.ex.Även om medlemmarna i varje grupp av proteolytiska enzymer kan ha mycket olika biologiska funktioner, visar aminosyraanalysen ofta en hög grad av strukturell likhet mellan dem. Detaljerad kunskap om strukturen och verkningsmekanismen hos ett enzym kan i många fall avslöja en förståelse för strukturen och funktionerna hos andra enzymer inom samma grupp.
Klasser av proteaser |
|
Namn | aktivitetsplats |
serinproteaser | Ser His Asp* |
cysteinproteaser | Cys His Asp* |
aspartiska proteaser | Asp Asp |
metallo proteaser | His His His Zn2+ |
*Asp inte alltid närvarande |