Pearl Harbor a fost inițial o întinsă insuliță de mică adâncime numită Wai Momi (ceea ce înseamnă, „apele Perlei”) sau Puʻuloa (ceea ce înseamnă, „dealul lung”) de către hawaiieni. Puʻuloa era considerată ca fiind casa zeiței rechinului, Kaʻahupahau, și a fratelui (sau fiului) ei, Kahiʻuka, în legendele hawaiiene. Potrivit tradiției, Keaunui, șeful puternicilor șefi Ewa, este creditat cu tăierea unui canal navigabil în apropierea actualei saline Puʻuloa, prin care a făcut ca estuarul, cunoscut sub numele de „Râul Perlelor”, să fie accesibil navigației. Ținând cont în mod corespunzător de amplificarea legendară, estuarul avea deja o ieșire pentru apele sale acolo unde se află actuala breșă; dar lui Keaunui i se atribuie în mod obișnuit meritul de a-l fi lărgit și adâncit.
Secolul al XIX-lea
Pearl Harbor în anii 1880.
La începutul secolului al XIX-lea, Pearl Harbor nu a fost folosit pentru nave mari din cauza intrării sale puțin adânci. Interesul Statelor Unite pentru Insulele Hawaii a crescut ca urmare a activității sale de vânătoare de balene, de navigație și de comerț în Pacific. Încă din 1820, un „Agent al Statelor Unite pentru comerț și marinari” a fost numit pentru a se ocupa de afacerile americane în portul Honolulu. Aceste legături comerciale cu continentul american au fost însoțite de activitatea Consiliului american al comisarilor pentru misiuni străine (American Board of Commissioners for Foreign Missions). Misionarii americani și familiile lor au devenit o parte integrantă a corpului politic hawaiian.
În anii 1820 și 1830, multe nave de război americane au vizitat Honolulu. În cele mai multe cazuri, ofițerii comandanți transportau scrisori din partea guvernului american care ofereau sfaturi cu privire la afacerile guvernamentale și la relațiile națiunii insulare cu puterile străine. În 1841, ziarul Polynesian, tipărit în Honolulu, susținea ca SUA să înființeze o bază navală în Hawaii pentru protecția cetățenilor americani angajați în industria vânătorii de balene. Ministrul britanic al afacerilor externe din Hawaii, Robert Crichton Wyllie, a remarcat în 1840 că „… părerea mea este că valul evenimentelor se grăbește spre anexarea la Statele Unite.”
De la încheierea Războiului Civil, la cumpărarea Alaskăi, la importanța crescută a statelor din Pacific, la comerțul proiectat cu țările din Asia și la dorința de a avea o piață fără taxe vamale pentru alimentele de bază hawaiiene, comerțul hawaiian s-a extins. În 1865, a fost înființată Escadrila Pacificului de Nord pentru a cuprinde coasta de vest și Hawaii. În anul următor, Lackawanna a fost desemnat să facă o croazieră printre insule, „o localitate de un interes și o importanță mari și în creștere”. Această navă a cercetat nord-vestul insulelor Hawaii spre Japonia. Ca urmare, Statele Unite au revendicat Insula Midway. Secretarul Marinei a putut scrie în raportul său anual din 1868 că, în noiembrie 1867, 42 de steaguri americane fluturau deasupra balenierelor și navelor comerciale din Honolulu, față de numai șase ale altor națiuni. Această activitate crescută a determinat alocarea permanentă a cel puțin unei nave de război în apele hawaiiene. De asemenea, a lăudat Insula Midway ca posedând un port care îl întrecea pe cel din Honolulu. În anul următor, la 1 martie 1869, Congresul a aprobat un credit de 50.000 de dolari pentru a aprofunda căile de acces la acest port.
Fotografie de astronaut a portului Pearl Harbor din octombrie 2009
După 1868, când comandantul Flotei Pacificului a vizitat insulele pentru a se ocupa de interesele americane, ofițerii de marină au jucat un rol important în afacerile interne. Ei au servit ca arbitri în disputele de afaceri, negociatori ai acordurilor comerciale și apărători ai legii și ordinii publice. Călătorii periodice între insule și pe continent la bordul navelor de război americane au fost organizate pentru membrii familiei regale hawaiiene și pentru oficiali importanți ai guvernului insular. Când regele Lunalilo a murit în 1873, negocierile erau în curs de desfășurare pentru cedarea Pearl Harbor ca port pentru exportul de zahăr în SUA fără taxe vamale. Odată cu alegerea regelui Kalākaua în martie 1874, revoltele au determinat debarcarea marinarilor de pe USS Tuscarora și Portsmouth. Nava de război britanică, HMS Tenedos, a debarcat, de asemenea, o forță simbolică. În timpul domniei regelui Kalākaua, Statelor Unite li s-a acordat dreptul exclusiv de a intra în Pearl Harbor și de a înființa „o stație de carbonatare și reparații.”
Deși acest tratat a continuat să fie în vigoare până în august 1898, SUA nu au fortificat Pearl Harbor ca bază navală. Așa cum a făcut-o timp de 60 de ani, intrarea puțin adâncă a constituit o barieră formidabilă împotriva utilizării apelor adânci și protejate ale portului interior.
Statele Unite și Regatul Hawaii au semnat Tratatul de reciprocitate din 1875, completat prin convenție, la 6 decembrie 1884. Acest tratat a fost ratificat în 1887. La 20 ianuarie 1887, Senatul Statelor Unite a permis Marinei Militare dreptul exclusiv de a menține o stație de carbonatare și reparații în Pearl Harbor. (SUA a intrat în posesie la 9 noiembrie în acel an). Războiul hispano-american din 1898 și dorința Statelor Unite de a avea o prezență permanentă în Pacific au contribuit la această decizie.
Prezența navală (1899-prezent)
USS Arizona, în timpul atacului japonez asupra Pearl Harbor, 7 decembrie 1941
După răsturnarea Regatului Hawaiian, Marina Statelor Unite a stabilit o bază pe insulă în 1899. La 7 decembrie 1941, baza a fost atacată de avioanele și submarinele pitice ale Marinei Imperiale Japoneze, provocând intrarea americanilor în cel de-al Doilea Război Mondial. Nu a existat niciun plan semnificativ pentru apărarea aeriană a insulei Hawaii, deoarece comandanții americani nu aveau nicio înțelegere a capacităților și a modului adecvat de utilizare a puterii aeriene. Așa stând lucrurile, dacă Flota Pacificului ar fi acționat în urma avertismentelor de război, fără îndoială că ar fi pornit și s-ar fi aflat pe mare la 7 decembrie, unde principalele nave ar fi fost scufundate în ape adânci, ceea ce ar fi făcut imposibilă salvarea. La scurt timp după devastatorul atac surpriză japonez de la Pearl Harbor, doi comandanți militari americani, generalul-locotenent Walter Short și amiralul Husband Kimmel, au fost retrogradați din gradele lor depline. Cei doi comandanți americani au căutat ulterior să-și restabilească reputația și gradele depline.
După cel de-al Doilea Război Mondial
De-a lungul anilor, Pearl Harbor a rămas o bază principală pentru Flota americană din Pacific după cel de-al Doilea Război Mondial, împreună cu baza navală San Diego. În 2010, Marina și Forțele Aeriene au fuzionat cele două baze din apropiere; Pearl Harbor s-a unit cu Baza Forțelor Aeriene Hickam pentru a crea Baza comună Pearl Harbor-Hickam.
În decembrie 2016, premierul japonez Shinzo Abe a efectuat o vizită comună la Pearl Harbor cu președintele american Barack Obama. Această călătorie a marcat cea de-a 75-a aniversare a atacului și a fost prima vizită oficială a unui lider japonez în exercițiu.
În decembrie 2019, un marinar al Marinei americane a ucis doi lucrători civili și a rănit un altul, înainte de a se împușca în Șantierul Naval Pearl Harbor.
La 11 mai 2020, s-a anunțat că o expediție comună a Ocean Infinity, cu nava sa Pacific Constructor, și centrul de operațiuni al SEARCH Inc. condus de Dr. James Delgado, a descoperit epava Nevada. Aceasta se află la o adâncime de 4.700 m (15.400 picioare) în largul coastei Hawaii și la aproximativ 65 de mile marine la sud-vest de Pearl Harbor. Arheologii au documentat, de asemenea, cele două catarge tripode, porțiuni din pod, secțiuni de punte și suprastructură, precum și un rezervor plasat pe punte pentru testele cu bombe atomice. Fuselajul era încă vopsit, iar numărul „36” era vizibil pe pupa. Ca urmare a crizei globale de sănătate pandemică COVID-19, nava a rămas pe mare pentru o varietate de sarcini.
.