A skót tojás eredetéről és etimológiájáról számos különböző elmélet létezik, és nincs biztos következtetés. Az Oxford English Dictionary az elnevezés első előfordulását 1809-ben, Maria Rundell A New System of Domestic Cookery című művének egyik kiadásában említi. A recept ugyanennek a könyvnek az 1805-ös első kiadásában jelent meg. Akkoriban még nem volt kenyérmorzsás réteg, bár 1861-ben Isabella Beeton már ezt is javasolta, mint lehetőséget. Az Oxford Companion to Food feltételezi, hogy az eredet az indiai koftas lehet.
A londoni Fortnum & Mason áruház hideg ételként azt állítja, hogy 1738-ban találta fel a skót tojást, mint utazók snackjét, de ezt az azóta elveszett levéltári anyagokra alapozta. A Fortnum & Mason minden bizonnyal népszerűsítette a skót tojást, és az élelmiszert különböző kosarak részeként kínálta. Általában úgy vélik, hogy a skót tojás viszont a britek által a Rajban megismert ételekből származik, többek között a nargisi kofta (“nárciszos húsgombóc”) nevű muglai ételből.
Más állítások szerint a név a Wellington Barracks környékén élő londoniak becenevéből származik, akik az ott állomásozó skót gárda tisztjei után kapták a snack ízét. A Culinary Delights of Yorkshire szerint az Angliában, a yorkshire-i Whitbyből származik a 19. században, és eredetileg nem kolbászhússal, hanem halpasztával borították. Állítólag William J. Scott & Sons, egy ismert étkezde után kapta a nevét, amely ezeket árulta. A dátum azonban nem illeszkedik a kifejezés legalább 75 évvel korábbi ismert használatához. Azt is feltételezik, hogy eredetileg “perzselt” tojásoknak hívták őket, mivel nyílt lángon sütötték, bár a fennmaradt receptek szerint zsírban sütötték őket. A “scotching” mint kulináris eljárás eredetére is hivatkoznak néha, bár az, hogy mit jelentett a “scotching”, értelmezhető, a szardellák hozzáadásától kezdve a hús egyszerű darálásáig. További zavart okoz a 19. században Skóciából származó tojások nagymértékű kereskedelme, amelynek során a tojásokat néha mészporba mártották, ami valószínűleg szintén “scotching” néven ismert eljárás volt.