En almindelig “Circle Ninja”-variant kræver, at spillerne bevæger sig med uret i stedet for i en hvilken som helst retning.
I “Ultimate Ninja” placerer spillerne sig i en cirkel og skiftes til at bevæge sig med uret i en cirkel. Denne variant tilføjer dog målet om at slå enten med hænderne eller fødderne. Spillerne er også i stand til at undvige flere angreb før deres tur. Typisk har “ultimate ninja” spillerne til at gennemføre mere komplekse manøvrer som f.eks. vognhjul, glidende spark, springspark osv.
En anden variant specificerer, at spillerne kun har ét liv, dvs. når den ene hånd bliver ramt, anses spilleren for at være ude.
Nogle spil har en “lynrunde”, hvor to spillere angriber hinanden og forsøger ikke at stoppe, før den ene bliver ramt i hånden. Spillet er slut, når en spiller bliver ramt i hånden, stopper bevægelsen eller bliver forvirret under sin tur. Mange spiller en hurtig én mod én-variant, hvor spillerne skal stå tå mod tå under hele spillet.
I “Ninja Balance” kan spillerne kun bruge den ene hånd, og den anden er placeret bag ryggen og må ikke røre noget. De højre hænder er bundet sammen, og spillerne kan ikke bevæge den ene fod, som er plantet yderste ankelben til tå. Spillerne scorer et hit ved at røre en hvilken som helst del af modstanderen med deres finger på den bundne hånd, eller når de får den anden spiller til at miste balancen og bevæge sin plantede fod. Tre træffere er en sejr. Spillerne diskvalificeres, hvis de forårsager skade eller bruger den døde hånd til andet end at holde balancen.
En anden variation omfatter “øjeblikkelig død”-reglen. Den mest almindelige version er, når en spiller slår en anden spiller på næsen. Andre steder som nakken og panden kan også bruges.
En anden variant er en 2-spiller-version, hvor spillerne ikke må omplacere mere end 2 gange i træk. Og målene er stadig hænderne, og varianten kan også bruges almindeligt til at lave en ninja-turnering