Putamen (og striatum som helhed) menes at fungere som et kritisk inputområde for de basale ganglier. Med andre ord skal basalganglierne for at udføre deres bevægelsesrelaterede funktioner modtage oplysninger fra hjernebarken om bevægelser, som man ønsker at udføre, for at kunne udføre deres bevægelsesrelaterede funktioner. En stor del af disse oplysninger sendes først til putamen eller caudate via en vej, der kaldes den kortikostriatale vej.
De fleste af neuronerne i putamen indeholder neurotransmitteren GABA og strækker sig ud fra putamen til andre regioner i de basale ganglier – specifikt globus pallidus og substantia nigra. Disse neuroner, der forlader putamen, skaber baner, der menes at være involveret i enten facilitering eller hæmning af bevægelser (afhængigt af banerne). Forskning tyder på, at neuroner i putamenen aktiveres før og under bevægelse – især bevægelse af lemmer og torso. Man mener, at fyringen af disse putamen-neuroner ikke kun bidrager til igangsættelsen af en bevægelse, men også til beslutningen om at foretage en bevægelse og til valget af den bevægelse, der skal foretages.
I årevis blev putamenen anset for primært at være afsat til bevægelse. Men nyere forskning er begyndt at pege på en udvidet rolle for putamenerne. F.eks. mener man nu, at putamenen også er involveret i indlæring og hukommelse, sprog og følelser.
Dysfunktion i putamen kan være en faktor i en række lidelser, men er stærkt forbundet med problemer med motoriske funktioner. Huntingtons sygdom (HD), for eksempel – som er karakteriseret ved hurtige og krampagtige ufrivillige bevægelser – er for eksempel forbundet med degeneration og død af neuroner i caudat og putamen. Disse neuroner kan være involveret i hæmningen af uønskede bevægelser, og deres degeneration i HD kan medføre, at ufrivillige bevægelser er sværere at undertrykke.
Neurodegeneration i de basale ganglier er også det karakteristiske patologiske tegn på Parkinsons sygdom (PD), en tilstand, der forårsager langsomme, besværlige bevægelser sammen med rysten (blandt andre symptomer). Ved PD forekommer neurodegenerationen primært i substantia nigra, men andre områder af de basale ganglier – som f.eks. putamen – er også påvirket. Desuden menes abnormiteter i dopaminfunktionen i putamen at bidrage til de bevægelsesproblemer, som PD-patienter oplever.