Typer af patogenese omfatter mikrobiel infektion, inflammation, malignitet og vævsnedbrydning. For eksempel er bakteriel patogenese den mekanisme, hvormed bakterier forårsager smitsomme sygdomme.
De fleste sygdomme skyldes flere processer. For eksempel opstår visse kræftformer som følge af dysfunktion i immunsystemet (hudtumorer og lymfekræft efter en nyretransplantation, som kræver immunosuppression).
De patogene mekanismer for en sygdom (eller tilstand) sættes i gang af underliggende ætiologiske årsager, som, hvis de kontrolleres, vil gøre det muligt at forebygge sygdommen. Ofte identificeres en potentiel ætiologi ved epidemiologiske observationer, før der kan drages en patologisk forbindelse mellem årsagen og sygdommen. Det patologiske perspektiv kan integreres direkte i en epidemiologisk tilgang inden for det tværfaglige område molekylærpatologisk epidemiologi (MPE). MPE kan bidrage til at vurdere patogenese og kausalitet ved at sammenkæde en potentiel ætiologisk faktor med molekylærpatologiske signaturer for en sygdom.