Kort efter kl. 22.00 den 14. april 1865 gik skuespilleren John Wilkes Booth ind i præsidentens loge i Ford’s Theatre i Washington, D.C., og skød præsident Abraham Lincoln med døden til følge. Da Lincoln sank fremad i sit sæde, sprang Booth op på scenen og flygtede ud ad bagdøren. Den lamme præsident blev straks undersøgt af en læge i salen og blev derefter båret over gaden til Petersen House, hvor han døde tidligt næste morgen.
Da han døde som han gjorde, ved voldens røde hånd, dræbt, snigmyrdet, bortført uden varsel, ikke på grund af personligt had … men på grund af sin troskab mod union og frihed, er han dobbelt så kær for os, og hans minde vil være værdifuldt for evigt.
Oration af Frederick Douglass, holdt i anledning af afsløringen af de frigivnes monument til minde om Abraham Lincoln, i Lincoln Park, Washington, D. C., den 14. april 1876… Washington, D. C..: Gibson brothers, trykkeri, 1876. African American Perspectives: Materialer udvalgt fra den sjældne bogsamling. Sjældne bøger & Special Collections Division
Lincolns mord var det første mord på en præsident i USA’s historie. Booth udførte attentatet fem dage efter, at general Robert E. Lee havde overgivet Army of Northern Virginia til general Ulysses S. Grant ved Appomattox Court House i Virginia. Han troede, at hans handling ville hjælpe sydstaterne. Mistanken om, at Booth havde handlet som en del af en sammensværgelse af sympatisører fra sydstaterne, øgede nordstaternes vrede. Hvorvidt Lincoln ville have været i stand til at dæmpe den genopbygningspolitik, der blev vedtaget af de radikale republikanere i Kongressen, er overladt til historisk spekulation på grund af hans alt for tidlige død, da USA gik fra borgerkrig til genforening og fred.
I løbet af få dage efter mordet udsendte krigsministeriet efterlysningsplakater med henblik på anholdelse af Booth og hans medskyldige John Surratt og David Herold. Booth og Herold undgik at blive fanget indtil den 26. april, hvor føderale tropper opdagede, at de gemte sig i en tobakslade nær Bowling Green i Virginia. Herold overgav sig, men Booth holdt sig i dækning og blev skudt, mens laden brændte ned til grunden. Han døde senere samme dag.
Booths medsammensvorne Lewis Powell (alias Payne) – som havde forsøgt at myrde udenrigsminister William H. Seward-George Atzerodt, David Herold og Mary Surratt – blev alle henrettet for deres deltagelse i mordkomplottet. Flere andre konspiratorer blev idømt fængselsstraffe.
Præsident Lincolns død resulterede i en strøm af sorg over hele landet. Efter en begravelse i Det Hvide Hus og liggende i staten på det amerikanske Capitol blev Lincolns lig transporteret til jernbanestationen, hvor det begyndte en 1.700 miles lang rejse tilbage til præsidentens fødeby Springfield, Illinois. Den 4. maj blev Lincoln endelig lagt til hvile i en grav på Oak Ridge Cemetery.
Mange monumenter blev bygget til ære for Abraham Lincoln i årenes løb, i hele landet og i hele verden. Den 14. april 1876 holdt Frederick Douglass en tale ved afsløringen af et monument til Lincoln, der stod i Lincoln Park i Washington, D.C. Mere kendt i nationen er et andet mindesmærke for Lincoln, som også ligger i Washington, D.C. Lincoln Memorial, der har en monumental skulptur af Daniel Chester French, står ved foden af nationens Mall og blev indviet den 30. maj 1922.