Parental Imprinting
Et andet eksempel på epigenetisk arv, som blev opdaget for omkring 10 år siden hos pattedyr, er forældreprægning. Ved parental imprinting har visse autosomale gener tilsyneladende usædvanlige arvelighedsmønstre. Eksempelvis udtrykkes Igf2-genet fra musen kun i en mus, hvis det er nedarvet fra musens far. Man siger, at det er moderligt præget, idet en kopi af genet, der stammer fra moderen, er inaktiv. Omvendt udtrykkes H19-genet i musen kun, hvis det er arvet fra moderen; H19 er faderligt præget. Konsekvensen af forældrenes prægning er, at de prægede gener kommer til udtryk, som om de var hæmizygote, selv om der er to kopier af hvert af disse autosomale gener i hver celle. Når disse gener undersøges på molekylært niveau, ses der desuden ingen ændringer i deres DNA-sekvenser. De eneste ændringer, der ses, er derimod ekstra methylgrupper (-CH3) på visse baser i DNA’et i de prægeprægede geners DNA. Enkelte baser i DNA’et hos de fleste højere organismer er methylerede (en undtagelse er Drosophila). Disse methylgrupper tilføjes og fjernes enzymatisk ved hjælp af særlige methylaser og demethylaser. Methyleringsniveauet korrelerer generelt med et gens transkriptionelle tilstand: aktive gener er mindre methylerede end inaktive gener. Det er imidlertid uvist, om ændrede niveauer af DNA-methylering forårsager epigenetiske ændringer i genaktivitet, eller om ændrede methyleringsniveauer opstår som en konsekvens af sådanne ændringer.
Hvad har disse eksempler på epigenetisk arv til fælles? Hovedtråden er, at et stykke af et kromosom på en eller anden måde kan mærkes som forskelligt på grundlag af dets forfædre eller på grundlag af, hvilke andre gener der var i det samme genom. For mange af disse eksempler gælder det, at forskelle i DNA-methylering er blevet forbundet med forskelle i genaktivitet. Ikke desto mindre synes de underliggende mekanismer og begrundelser for, hvorfor sådanne systemer har udviklet sig, stadig temmelig mystiske.