Bløvminér forårsager skade på planter både direkte og indirekte. Den mest direkte skade forvoldes af larverne, der udgraver bladvævet, hvilket fører til udtørring, for tidligt bladfald og kosmetiske skader. I tropiske og subtropiske områder kan dette føre til forbrænding af frugter som f.eks. tomat og melon. Tab af blade reducerer også udbyttet. Hos fuldvoksne planter af frugtbærende grønsagsafgrøder kan en betydelig mængde løv dog blive beskadiget, før høsten påvirkes.
Størrelsen af en bladtunnel afhænger af bladets udviklingsstadie, værtsplantens art og minérbladsarten. De ældre larver laver bredere tunneler. De voksne hunner kan også reducere udbyttet ved at æde pletter, men bortset fra prydplanter er dette normalt af mindre betydning. Frøplanter og unge planter kan blive fuldstændig ødelagt som følge af de direkte skader forårsaget af minérfluer.
Indirekte skader opstår, når sygdomsfremkaldende svampe eller bakterier trænger ind i plantevævet via ædepletterne. Minerne fra ærte-mineren (Liriomyza huidobrensis) løber ofte langs midter- og sideårer, men kan også løbe uregelmæssigt over hele bladet. Når der kommer flere miner på et blad, kan der dannes en stor “plademine”. Disse er for det meste placeret ved bladets basis.