Il existe des temples dédiés à Mout encore debout dans l’Égypte et le Soudan actuels, ce qui reflète le culte répandu de cette dernière. Le centre de son culte au Soudan est devenu le temple Mut de Jebel Barkal et en Égypte le temple de Karnak. C’est dans ce temple que se trouvait la statue qui était considérée comme l’incarnation de son véritable ka. Ses dévotions comprenaient les rituels quotidiens du pharaon et de ses prêtresses. Les reliefs intérieurs représentent des scènes de prêtresses, actuellement le seul exemple connu restant de culte dans l’Égypte ancienne qui était exclusivement administré par des femmes.
En général, la reine servait de prêtresse principale dans les rituels du temple. Le pharaon participait également et devenait une divinité après la mort. Dans le cas où le pharaon était une femme, les enregistrements d’un exemple indiquent qu’elle faisait servir sa fille comme grande prêtresse à sa place. Les prêtres étaient souvent chargés de l’administration des temples et des oracles où les prêtresses accomplissaient les rites religieux traditionnels. Ces rites incluaient la musique et la boisson.
Le pharaon Hatchepsout fit reconstruire l’ancien temple de Mout à Karnak pendant son règne à la dix-huitième dynastie. Les fouilleurs précédents avaient pensé qu’Amenhotep III avait fait construire le temple en raison des centaines de statues de Sekhmet qui y ont été trouvées et qui portaient son nom. Cependant, Hatchepsout, qui a achevé un très grand nombre de temples et de bâtiments publics, avait terminé les travaux soixante-quinze ans plus tôt. Elle prit l’habitude de représenter Mout avec la couronne de Haute et de Basse-Égypte. On pense qu’Amenhotep III a fait disparaître la plupart des signes d’Hatchepsout, tout en s’attribuant le mérite des projets qu’elle avait construits.
Hatshepsout était un pharaon qui a remis Mout au premier plan dans le panthéon égyptien, s’identifiant fortement à la déesse. Elle a déclaré qu’elle était une descendante de Mout. Elle s’est également associée à l’image de Sekhmet, en tant qu’aspect plus agressif de la déesse, ayant servi de guerrier très performant pendant la première partie de son règne en tant que pharaon.
Plus tard dans la même dynastie, Akhenaton a supprimé le culte de Mout ainsi que les autres divinités lorsqu’il a promu le culte monothéiste de son dieu du soleil, Aton. Toutankhamon rétablit plus tard son culte et ses successeurs continuèrent à s’associer à Mout par la suite.
Ramesses II ajouta d’autres travaux sur le temple de Mout au cours de la dix-neuvième dynastie, ainsi que la reconstruction d’un temple plus ancien dans la même zone, le redédiant à Amon et à lui-même. Il le plaça de telle sorte que les gens devaient passer devant son temple pour se rendre à celui de Mout.
Les pharaons kouchites agrandirent le temple de Mout et modifièrent le temple de Ramsès pour l’utiliser comme sanctuaire de la naissance célébrée d’Amon et de Khonsou, essayant de s’intégrer dans la succession divine. Ils installèrent également leurs propres prêtresses dans les rangs des prêtresses qui officiaient au temple de Mout.
La dynastie grecque ptolémaïque ajouta également ses propres décorations et prêtresses au temple et utilisa l’autorité de Mout pour mettre en avant ses propres intérêts.
Plus tard, l’empereur romain Tibère reconstruisit le site après une grave inondation et ses successeurs soutinrent le temple jusqu’à ce qu’il tombe en désuétude, vers le troisième siècle de notre ère. Plus tard, les fonctionnaires romains ont utilisé les pierres du temple pour leurs propres projets de construction, souvent sans altérer les images qui y étaient sculptées.