Patogeneesin tyyppejä ovat mikrobiperäinen infektio, tulehdus, pahanlaatuisuus ja kudosten hajoaminen. Esimerkiksi bakteeripatogeneesi on mekanismi, jolla bakteerit aiheuttavat tartuntataudin.
Useimmat sairaudet johtuvat useista prosesseista. Esimerkiksi tietyt syövät syntyvät immuunijärjestelmän toimintahäiriöistä (ihokasvaimet ja munuaisensiirron jälkeinen lymfooma, joka edellyttää immunosuppressiota).
Sairauden (tai tilan) patogeneettiset mekanismit käynnistyvät taustalla olevista etiologisista syistä, joiden hallitseminen mahdollistaisi sairauden ehkäisemisen. Usein mahdollinen etiologia tunnistetaan epidemiologisten havaintojen perusteella, ennen kuin syyn ja taudin välille voidaan luoda patologinen yhteys. Patologinen näkökulma voidaan integroida suoraan epidemiologiseen lähestymistapaan molekyylipatologisen epidemiologian (MPE) monitieteellisellä alalla. MPE voi auttaa arvioimaan patogeneesiä ja kausaliteettia yhdistämällä mahdollinen etiologinen tekijä taudin molekyylipatologisiin patologisiin merkkeihin.