Asperger-profiilin omaavilla ihmisillä on ehdottomasti tunteita, vaikka heillä voi olla vaikeuksia tunnistaa niitä ja keskustella niistä. Itse asiassa monet tunteet – kuten pelko, viha ja ilo – näyttävät olevan Asperger-profiilin omaavilla henkilöillä voimakkaampia kuin tavallisilla ihmisillä. Lisäksi jotkut Asperger-profiilista kärsivät henkilöt kertovat, että he sisäistävät syvästi toisten tunteet niin, että jos joku toinen on järkyttynyt, myös he itse järkyttyvät nopeasti. Näin näyttää tapahtuvan enemmän henkilöillä, joilla on Asperger-profiili, kuin tavallisella väestöllä. Ihmiset, joilla on Asperger-profiili, eivät välttämättä osoita tunteitaan samalla tavalla tai samassa määrin kuin ihmiset, joilla ei ole Asperger-profiilia. He saattavat ilmaista tunteita vähemmän ulospäin, tai heidän ilmeensä ei ehkä vastaa sitä, mitä henkilö tuntee sisällään.
Asperger-profiilista kärsivillä ihmisillä on empatiaa huolimatta valitettavasta leimasta, joka antaa ymmärtää muuta. Itse asiassa Nature’s Scientific Reports -lehdessä hiljattain julkaistussa tutkimuksessa sosiaalisen neurotieteen tutkija tohtori Indrajeet Patil sanoi: ”Havaitsimme, että autistiset henkilöt eivät eronneet millään tavalla terveistä kontrolleista moraalisen päätöksenteon suhteen. Itse asiassa he tekivät moraalisia päätöksiä, jotka viittasivat siihen, että he olivat keskimäärin vastahakoisempia aiheuttamaan haittaa muille, vaikka tämä tuottaisi parempia tuloksia.” Asperger-profiilista kärsiviä ei välttämättä tunnisteta empaattisista ominaisuuksistaan, koska empatian tuntemis- ja ilmaisutavat vaihtelevat. Jotkut ihmiset tuntevat syvää empatiaa, mutta eivät ilmaise näitä tunteita ulospäin kasvojen ilmeillä tai kielellä. Jotkut ihmiset tulevat empatiaan älyllisten prosessien kautta, jolloin he käyttävät logiikkaa ja päättelyä päästäkseen tunteisiin. On myös tärkeää pitää mielessä, että monet ihmiset, joilla on Asperger-profiili, ovat aiemmin joutuneet ikätovereidensa kiusaamiksi tai syrjäytetyiksi, ja he saattavat siksi olla varovaisia ihmisten seurassa, mikä voi näkyä empatian puutteena. Ihmiset, joilla on Asperger-profiili, voivat olla ja ovat erittäin huolehtivia yksilöitä; itse asiassa on erityisen yleistä, että profiilin omaavat tuntevat ja osoittavat syvää huolta ihmisten hyvinvoinnista, eläinten oikeuksista, ympäristönsuojelusta ja muista globaaleista ja humanitaarisista asioista.