Una variante común del «Ninja del Círculo» requiere que los jugadores se muevan en el sentido de las agujas del reloj en lugar de en la dirección que deseen.
En el «Ninja Definitivo», los jugadores se colocan en un círculo y se turnan en el sentido de las agujas del reloj. Esta variante, sin embargo, añade el objetivo de golpear las manos o los pies. Los jugadores también pueden esquivar múltiples ataques antes de su turno. Normalmente, el ninja definitivo hace que los jugadores completen maniobras más complejas como volteretas, patadas de deslizamiento, patadas de salto, etc.
Otra variante especifica que los jugadores sólo tienen una vida, es decir, cuando una mano es golpeada, el jugador se considera fuera.
Algunos juegos tienen una «ronda relámpago» en la que dos jugadores se atacan mutuamente e intentan no parar hasta que uno es golpeado en la mano. El juego termina cuando un jugador es golpeado en la mano, detiene el movimiento o se confunde durante su turno. Mucha gente juega a una variante rápida de uno contra uno en la que los jugadores deben estar mano a mano durante toda la partida.
En el «Equilibrio Ninja», los jugadores sólo pueden usar una mano y la otra se coloca detrás de la espalda y no puede tocar nada. Las manos derechas están atadas juntas y los jugadores no pueden mover un pie que está plantado hueso exterior del tobillo a la punta del pie. Los jugadores anotan un golpe al tocar cualquier parte del oponente con el dedo de la mano atada o cuando hacen que el otro jugador pierda el equilibrio y mueva su pie plantado. Tres golpes suponen una victoria. Los jugadores son descalificados por causar una lesión o por usar la mano muerta para cualquier cosa que no sea el equilibrio.
Otra variación incluye la regla de «muerte instantánea». La versión más común es cuando un jugador golpea a otro en la nariz. También se pueden utilizar otros lugares como el cuello y la frente.
Otra variante es una versión de 2 jugadores y se permite a los jugadores cambiar de posición no más de 2 veces seguidas. Y los objetivos siguen siendo las manos y la variante también se puede utilizar comúnmente para hacer un torneo ninja