Lynch trabajó con Todd English (desde 1989) durante varios años antes de marcharse a recorrer Italia. Cuando regresó a Boston, fue nombrada chef ejecutiva de la trattoria Galleria Italiana, y posteriormente ganó el premio de Food & Wine a los «Diez mejores nuevos chefs de Estados Unidos».
En 1998, abrió su primer restaurante, No. 9 Park, cerca del Boston Common y del Massachusetts State House.
Su empresa Barbara Lynch Gruppo tiene ahora 220 empleados y factura unos 20 millones de dólares al año. Supervisa una empresa de catering y varios restaurantes populares: No. 9 Park (un restaurante estándar de Brahmin Beacon Hill), Sportello (un local de pasta para citas), Drink (un bar de cócteles artesanales), B&G Oysters (un local de marisco), The Butcher Shop (una carnicería y cafetería), Menton (un establecimiento de alta cocina) y Stir (una cocina de demostración abierta en la que imparte clases). El Barbara Lynch Gruppo incluye los restaurantes de Boston No. 9 Park, B&G Oysters y Menton (nombrado en marzo de 2014 uno de los 10 mejores lugares para comer en Boston por USA Today).