Předpokládá se, že putamen (a striatum jako celek) funguje jako kritická vstupní oblast pro bazální ganglia. Jinými slovy, aby bazální ganglia mohla plnit své funkce související s pohybem, potřebují přijímat informace z mozkové kůry o pohybech, které chcete vykonat. Většina těchto informací putuje nejprve do putamen nebo kaudátu cestou zvanou kortikostriatální dráha.
Většina neuronů v putamen obsahuje neurotransmiter GABA a vystupuje z putamen do dalších oblastí bazálních ganglií – konkrétně do globus pallidus a substantia nigra. Tyto neurony, které opouštějí putamen, vytvářejí dráhy, o nichž se předpokládá, že se podílejí na facilitaci nebo inhibici pohybů (v závislosti na dráze). Výzkumy naznačují, že neurony v putamen jsou aktivovány před a během pohybu – zejména pohybu končetin a trupu. Předpokládá se, že vypalování těchto neuronů putamen přispívá nejen k zahájení pohybu, ale také k rozhodnutí pohyb vykonat a k výběru pohybu, který má být vykonán.
Po dlouhá léta se mělo za to, že putamen se věnuje především pohybu. Novější výzkumy však začaly poukazovat na rozšířenou roli putamen. Například se nyní předpokládá, že putamen se podílí také na učení a paměti, jazyku a emocích.
Dysfunkce putamen by mohla být faktorem řady poruch, ale je silně spojena s problémy s motorickými funkcemi. Například Huntingtonova choroba (HD) – která se vyznačuje rychlými a křečovitými mimovolními pohyby – je spojena s degenerací a odumíráním neuronů v kaudátu a putamen. Tyto neurony se mohou podílet na potlačování nežádoucích pohybů a jejich degenerace u HD může způsobovat, že je obtížnější potlačit mimovolní pohyby.
Neurodegenerace v bazálních gangliích je také charakteristickým patologickým znakem Parkinsonovy nemoci (PN), onemocnění, které způsobuje pomalé, namáhavé pohyby spolu s třesem (kromě jiných příznaků). U PD dochází k neurodegeneraci především v substantia nigra, ale postiženy jsou i další oblasti bazálních ganglií – například putamen. Navíc se předpokládá, že abnormality ve funkci dopaminu v putamen přispívají k pohybovým problémům, které pacienti s PD pociťují.
.