Oblast, kde se nádrž nachází, byla součástí Rancho Janal a koupil ji E. S. Babcock. Nádrž Lower Otay byla původně vytvořena v roce 1897 po vybudování přehrady Lower Otay společností Southern California Mountain Water Company. Původní přehrada byla typu kamenné výplně o výšce 125 stop (38 m). V roce 1900 zakoupil pozemky kolem nádrže John D. Spreckels a nádrž později získala společnost vlastněná Sprecklesem. U jezera se nacházela lovecká chata, kterou využívali hosté hotelu del Coronado.
Původní hráz povolila v lednu 1916 po silných deštích, které postihly většinu jižní Kalifornie a zaplavily údolí Otay Valley vodní stěnou o výšce od 20 do 100 stop (6,1 až 30,5 m), při níž zahynulo více než 14 lidí. Povodeň smetla celé farmy a budovy, včetně Montgomeryho rezidence ve Fruitlandu poblíž ústí řeky, kde John J. Montgomery postavil svou první sérii konstrukcí pilotovaných kluzáků. Deště byly údajně dílem „výrobce dešťů“ Charlese Hatfielda, který byl najat městem San Diego, aby pomohl zvýšit množství srážek a naplnit tak nedalekou nádrž Morena. Nikdy nebyl obviněn z žádného trestného činu. Následně byla postavena současná přehrada Arch-gravity. V roce 1934 byla pojmenována na počest Hirama Newtona Savage, městského inženýra, který dohlížel na její stavbu.
V roce 1936 koupil Stephen Birch pozemky kolem nádrže, které byly Rancho Otay. Jeho dcera Mary pozemky zdědila a po svatbě s bývalým velitelem královského letectva se přestěhovala do bývalé lovecké chaty na horním jezeře Otay, Rancho del Otay.
V únoru 2009 spatřil rybář na jezeře letoun Curtiss SB2C Helldiver. Dne 28. května 1945 bylo na cvičném bombardovacím letu z nedaleké letadlové lodi, když si zadřený motor vynutil nouzové přistání v nádrži. Potápěči letadlo prozkoumali 23. července 2009, aby zjistili, zda jej lze zachránit pro muzejní expozici, a 20. srpna 2010 bylo vyzdviženo.