Uma variante comum “Circle Ninja” requer que os jogadores se movam no sentido dos ponteiros do relógio e não em qualquer direcção que lhes agrade.
Em “Ultimate Ninja”, os jogadores posicionam-se num círculo e fazem turnos no sentido dos ponteiros do relógio. Esta variante, no entanto, adiciona o objectivo de esbofetear as mãos ou os pés. Os jogadores também são capazes de se esquivar de múltiplos ataques antes da sua vez. Tipicamente, o último ninja tem jogadores que completam manobras mais complexas como rodas de carro, pontapés de slide, saltos e assim por diante.
Uma outra variação especifica que os jogadores têm apenas uma vida, ou seja, quando uma mão é atingida, o jogador é considerado fora.
Alguns jogos têm uma “rodada relâmpago” onde dois jogadores atacam um ao outro e tentam não parar até que um seja atingido na mão. O jogo termina quando um jogador é atingido na mão, pára o movimento, ou fica confuso durante a sua vez. Muitas pessoas jogam uma variante rápida um-a-um onde os jogadores devem ficar de pé durante todo o jogo.
Em “Ninja Balance”, os jogadores só podem usar uma mão e a outra é colocada atrás das costas e não podem tocar em nada. As mãos direitas são unidas e os jogadores não podem mover um pé que está plantado no tornozelo exterior dos pés. Os jogadores marcam um golpe tocando qualquer parte do oponente com o dedo da mão encadernada ou quando fazem com que o outro jogador perca o equilíbrio e movimente o pé plantado. Três pancadas é uma vitória. Os jogadores são desclassificados por causar lesão ou por usar a mão morta para qualquer coisa que não seja equilíbrio.
Outra variação inclui a regra de “morte instantânea”. A versão mais comum é quando um jogador ataca outro no nariz. Outros locais como o pescoço e a testa também podem ser usados.
Uma outra variante é uma versão de 2 jogadores e os jogadores podem reposicionar não mais de 2 vezes seguidas. E os alvos ainda sendo as mãos e a variante também podem ser usados comumente para fazer um torneio ninja