Tipos de patogénese incluem infecção microbiana, inflamação, malignidade e ruptura de tecidos. Por exemplo, a patogênese bacteriana é o mecanismo pelo qual as bactérias causam doenças infecciosas.
As doenças mais comuns são causadas por múltiplos processos. Por exemplo, certos cancros surgem de disfunções do sistema imunológico (tumores de pele e linfoma após um transplante renal, que requer imunossupressão).
Os mecanismos patogénicos de uma doença (ou condição) são postos em movimento por causas etiológicas subjacentes, que se controladas permitiriam prevenir a doença. Muitas vezes, uma etiologia potencial é identificada por observações epidemiológicas antes que uma ligação patológica possa ser estabelecida entre a causa e a doença. A perspectiva patológica pode ser integrada diretamente em uma abordagem epidemiológica no campo interdisciplinar da epidemiologia molecular patológica (EMA). A EMA pode ajudar a avaliar a patogênese e a causalidade por meio da ligação de um potencial fator etiológico às assinaturas moleculares patológicas de uma doença.