Bij een veel voorkomende “Circle Ninja”-variant moeten de spelers met de klok mee bewegen in plaats van in een willekeurige richting.
In “Ultimate Ninja” plaatsen de spelers zich in een cirkel en bewegen ze om beurten met de klok mee. Deze variant voegt echter het doel toe om ofwel met de handen of met de voeten te slaan. De spelers zijn ook in staat om meerdere aanvallen voor hun beurt te ontwijken. Typisch voor ultimate ninja is dat de spelers meer complexe manoeuvres uitvoeren zoals cartwheels, slide kicks, jump kicks enzovoort.
Een andere variant specificeert dat de spelers slechts één leven hebben, dat wil zeggen dat wanneer één hand geraakt wordt, de speler als uit wordt beschouwd.
Sommige spellen hebben een “bliksem ronde” waar twee spelers elkaar aanvallen en proberen niet te stoppen totdat één in de hand wordt geraakt. Het spel is afgelopen als een speler in de hand wordt geraakt, de beweging stopt, of verward raakt tijdens zijn of haar beurt. Veel mensen spelen een snelle één-tegen-één variant waarbij de spelers gedurende het hele spel teen-tegen-teen moeten staan.
In “Ninja Balance” kunnen de spelers slechts één hand gebruiken en de andere wordt achter de rug geplaatst en mag niets aanraken. De rechterhanden zijn aan elkaar gebonden en de spelers kunnen één voet, die van buiten enkelbeen tot teen is geplant, niet bewegen. De spelers scoren een treffer door met hun vinger van de gebonden hand een deel van de tegenstander aan te raken of wanneer zij de andere speler uit balans brengen en zijn geplante voet bewegen. Drie treffers is een overwinning. Spelers worden gediskwalificeerd voor het veroorzaken van verwondingen of het gebruiken van de dode hand voor iets anders dan evenwicht.
Een andere variatie omvat de “onmiddellijke dood” regel. De meest voorkomende versie is wanneer een speler een ander op de neus slaat. Andere plaatsen zoals de hals en het voorhoofd kunnen ook worden gebruikt.
Een andere variant is een versie met 2 spelers en de spelers mogen niet meer dan 2 keer achter elkaar herpositioneren. En de doelwitten zijn nog steeds de handen en de variant kan ook algemeen gebruikt worden om een ninja toernooi te maken