Menschen mit Asperger-Profilen haben durchaus Gefühle, auch wenn es ihnen schwerfällt, sie zu erkennen und zu besprechen. In der Tat scheinen viele Gefühle – wie Angst, Wut und Freude – von Menschen mit Asperger-Profilen intensiver erlebt zu werden als von durchschnittlichen Menschen. Darüber hinaus berichten einige Personen mit Asperger-Profilen, dass sie die Gefühle anderer stark verinnerlichen, so dass sie, wenn jemand anderes verärgert ist, selbst schnell ebenfalls verärgert werden. Dies scheint bei Menschen mit Asperger-Profilen häufiger der Fall zu sein als bei der Allgemeinbevölkerung. Menschen mit Asperger-Profilen zeigen ihre Gefühle möglicherweise nicht auf dieselbe Weise oder in demselben Ausmaß wie Menschen ohne Asperger-Profil. Es kann sein, dass sie ihre Gefühle weniger nach außen zeigen oder dass ihr Gesichtsausdruck nicht dem entspricht, was die Person innerlich fühlt.
Menschen mit Asperger-Profilen verfügen über Empathie, trotz eines unglücklichen Stigmas, das das Gegenteil suggeriert. In einer kürzlich in Nature’s Scientific Reports veröffentlichten Studie sagte der Forscher für soziale Neurowissenschaften Dr. Indrajeet Patil: „Wir fanden heraus, dass sich autistische Personen in Bezug auf ihre moralischen Entscheidungen in keiner Weise von gesunden Kontrollpersonen unterscheiden. Vielmehr trafen sie moralische Entscheidungen, die darauf hindeuteten, dass sie im Durchschnitt eher geneigt waren, anderen Schaden zuzufügen, selbst wenn dies zu besseren Ergebnissen führte.“ Menschen mit Asperger-Profilen fallen möglicherweise nicht durch ihre empathischen Qualitäten auf, da die Art und Weise, wie Empathie empfunden und ausgedrückt wird, unterschiedlich ist. Manche Menschen empfinden tiefes Einfühlungsvermögen, teilen diese Gefühle aber nicht nach außen hin durch Mimik oder Sprache mit. Manche Menschen kommen durch intellektuelle Prozesse zu Empathie, indem sie Logik und Argumentation einsetzen, um zu ihren Gefühlen zu gelangen. Es ist auch wichtig zu bedenken, dass viele Menschen mit Asperger-Profilen in der Vergangenheit von Gleichaltrigen schikaniert oder ausgegrenzt wurden und daher in der Nähe von Menschen zurückhaltend sein könnten, was als Mangel an Empathie erscheinen könnte. Menschen mit Asperger-Profilen können äußerst fürsorgliche Menschen sein und sind es auch; tatsächlich ist es für Menschen mit diesem Profil besonders häufig, dass sie sich sehr für das Wohlergehen der Menschen, die Rechte der Tiere, den Umweltschutz und andere globale und humanitäre Anliegen einsetzen und dies auch zeigen.