Minatorul frunzelor provoacă daune plantelor atât direct, cât și indirect. Pagubele cele mai directe sunt cauzate de larvele care extrag țesutul foliar, ceea ce duce la desecare, căderea prematură a frunzelor și daune cosmetice. În zonele tropicale și subtropicale, acest lucru poate duce la arderea fructelor, cum ar fi roșiile și pepenii. Pierderea frunzelor reduce, de asemenea, producția. Cu toate acestea, la plantele adulte ale culturilor de legume fructifere, o cantitate considerabilă de frunze poate fi deteriorată înainte ca recolta să fie afectată.
Dimensiunea unui tunel foliar depinde de stadiul de dezvoltare al frunzei, de specia de plantă gazdă și de specia de minator de frunze. Larvele mai bătrâne fac tuneluri mai largi. Petele de hrănire făcute de femelele adulte pot reduce, de asemenea, randamentul, deși, cu excepția culturilor ornamentale, acest lucru este de obicei mai puțin important. Răsadurile și plantele tinere pot fi complet distruse ca urmare a daunelor directe provocate de minerii frunzelor.
Dăunele indirecte apar atunci când ciupercile sau bacteriile care provoacă boli pătrund în țesutul plantei prin intermediul petelor de hrănire. Minele minerului frunzelor de mazăre (Liriomyza huidobrensis) se întind adesea de-a lungul nervurilor mediane și laterale, dar se pot întinde și neregulat pe frunze. Atunci când apar mai multe mine pe o frunză, se poate forma o „mină-placă” mare. Acestea sunt localizate mai ales la baza frunzei.
.