Yukiteru Amano (天野雪輝) este un solitar de 14 ani, timid și visător cu ochii deschiși, care observă viața și își notează evenimentele pe telefonul mobil. Singurii săi prieteni sunt Deus Ex Machina (デウス・エクス・マキナ), Zeul Spațiului și al Timpului, și asistentul său Muru Muru (ムルムル). Deus transformă telefonul lui Yukiteru într-un Future Diary, capabil să prezică viitorul până la nouăzeci de zile. Yukiteru descoperă că el și alte unsprezece persoane fac parte dintr-un joc de supraviețuire orchestrat de Deus. Scopul acestui joc este de a-i elimina pe ceilalți deținători de jurnal, câștigătorul urmând să-i succeadă lui Deus ca zeu și să prevină Apocalipsa. Yukiteru se trezește protejat de Yuno Gasai (我妻由乃), o colegă de clasă fermecătoare, dar psihopată, care îl urmărește obsesiv după ce, cu un an înainte, au promis că vor merge împreună să privească stelele.
Doi jucători importanți pe care îi întâlnesc sunt terorista Minene Uryu, care vrea să distrugă toată religia după ce părinții ei au murit într-un război alimentat de credință; și Keigo Kurusu, un ofițer de poliție care vrea să pună capăt jocului. Mai târziu, Kurusu îi trădează pe Yukiteru și Yuno când descoperă că fiul său imobilizat la pat suferă de o boală terminală. El îl asasinează pe Karyuudo Tsukishima, deținătorul jurnalului, și le înscenează totul lui Yukiteru și Yuno. Minene apelează la detectivul Masumi Nishijima, demascând crima lui Kurusu. În rușinea sa, Kurusu se elimină singur din joc.
John Bacchus, primarul orașului și designerul Jurnalelor Viitorului, încearcă să-l manipuleze pe tatăl lui Yukiteru, Kurou, plin de datorii, să fure jurnalul fiului său. Kurou eșuează, omorându-și involuntar fosta soție, Rea, și este apoi asasinat de oamenii lui Bacchus. Yukiteru jură să câștige jocul și să-și învie părinții. El și Yuno îi vizează pe deținătorii de jurnal rămași, Minene, Bacchus și Kamado Ueshita, care conduce un orfelinat. Între timp, prietenul isteț al lui Yukiteru, Aru Akise, și Nishijima investighează descoperirea a trei cadavre în casa lui Yuno, două fiind părinții ei, iar al treilea identificat ca fiind Yuno Gasai, ceea ce pune sub semnul întrebării identitatea ei.
Jurnalul lui Kamado, care poate da altora jurnale înlocuitoare, este conectat la un supercomputer, oferind tuturor celor din oraș Jurnale viitoare ca parte a planului lui Bacchus de a ajuta omenirea să evolueze. Yukiteru și Yuno, Minene, Nishijima și prietenii lui Yukiteru iau cu asalt sediul lui Bacchus. Acesta se sigilează într-un seif bancar deținut de părinții lui Yuno, amprentele ei fiind singura cale de acces. Minene se sacrifică pentru a distruge seiful, dar nu reușește, doar pentru ca Aru să o vadă pe Yuno accesând seiful și omorându-l pe Bacchus. Dorind răspunsuri, Aru se confruntă cu Deus care îi dezvăluie că băiatul este un om artificial conceput pentru a observa jocul și a-l menține în echilibru, dar confirmă că există o conspirație în jurul lui Yuno.
Yukiteru își ucide prietenii și apoi pe Kamado. Aru se luptă cu Yuno, distrugându-i jurnalul, dar descoperă că are unul de rezervă. Dându-și seama de adevăr, Aru îi arată un text lui Yukiteru înainte ca Yuno să-l decapiteze. Pe măsură ce zilele până la Apocalipsă se apropie, Yukiteru și Yuno își consumă relația. Cu toate acestea, Yukiteru dezvăluie sugestia lui Aru că Yuno provine dintr-o altă linie temporală și ea se întoarce imediat împotriva lui. Muru Muru, adevăratul creier din spatele cursului jocului, confirmă teoria lui Aru. Yukiteru a murit și Yuno a câștigat jocul într-o altă linie temporală, dar a descoperit că nici măcar puterea unui zeu nu poate aduce înapoi morții. În durerea ei, Yuno s-a întors în timp, creând o linie temporală alternativă, ucigând și înlocuindu-și celălalt eu.
Yuno și Muru Muru se întorc din nou în timp, creând o a treia lume, urmărite de Yukiteru și Minene, ținute în viață de Deus ca un joker și impregnate cu o parte din puterea sa. Ambele părți se luptă pentru a o proteja sau a o ucide pe Yuno și pe părinții ei din a treia lume. Yuno, nereușind să-l ucidă pe Yukiteru, îl prinde într-o lume de vis în care ea nu există, iar apoi își atacă sinele alternativ. Yukiteru își amintește de Yuno, evadând din închisoarea sa, ajutat de Muru Muru din lumea a doua, și o oprește pe Yuno. Deși Yukiteru îi cere lui Yuno să îl ucidă pentru ca ea să poată trăi, ea se elimină în schimb și moare în brațele lui. Yukiteru devine zeu și este târât în cea de-a doua lume de Muru Muru.
Două mii de ani mai târziu, un Yukiteru îndurerat nu a făcut nimic cu puterile sale de zeu. El a reușit să taie toate influențele pe care prima și a doua lume le aveau cu cea de-a treia și îl împiedică pe zeul celei de-a treia lumi să moară. Yukiteru se uită la jurnalul său, plângând că nu o va mai vedea niciodată pe Yuno din prima lume, singura pe care o va iubi vreodată. Cu toate acestea, zidurile interdimensionale sunt dărâmate de Yuno din lumea a treia, care posedă amintirile primei lumi, mulțumită unui Muru Muru ispășitor. Yukiteru și Yuno se reunesc ca zei ai celei de-a doua lumi și iubiți eterni.
.