Pomimo różnorodności społeczeństw euroamerykańskich i amerykańskich Indian, wojny między nimi miały pewne wspólne cechy. W większości epok konfliktu, Euroamerykanie mieli indiańskich sprzymierzeńców; euroamerykańscy żołnierze-obywatele wykazywali tendencję do większej brutalności i mniejszej dyscypliny wojskowej niż zawodowi żołnierze; koczownicze grupy Indian zwykle prowadziły wojnę bardziej nieustępliwie niż te bardziej osiadłe; a wybuch i ekspansja wojny zwykle wynikały z euroamerykańskiego dążenia do zdobycia indiańskiej ziemi.
Podczas szesnastego i siedemnastego wieku, europejskie potęgi ustanowiły obecność wojskową w Ameryce Północnej, z której mogły wysuwać i bronić roszczeń przez prawo do odkrycia, osadnictwa lub podboju do ogromnych części kontynentu już zamieszkanego przez Indian. W odpowiedzi wielu rdzennych Amerykanów wszczęło wojny, by przeciwstawić się europejskiej dominacji kolonialnej. W XVII wieku Konfederacja Powhatan zagroziła istnieniu Kolonii Wirginia atakami w latach 1622 i 1644. Cztery dekady po zniszczeniu Pequotów w wojnie Pequotów (1636-37) koloniści z Nowej Anglii stanęli w obliczu masowego powstania Algonkinów żyjących w ich granicach w wojnie króla Filipa (1675-76). Bunt Pueblo (1680) wyparł Hiszpanów z Nowego Meksyku na trzynaście lat. W XVIII wieku koloniści w Wirginii i Karolinach siłą zdobyli ziemię od Tuscarorów, Yamasees i Czirokezów, podczas gdy Francuzi stłumili zbrojny opór Natchezów, Chickasaw i Foxów.
W tych i innych wojnach wiele grup Indian flirtowało ze zjednoczonym panindiańskim sojuszem przeciwko kolonistom, ale takie sojusze zwykle nie przynosiły rezultatów. Wraz z porażką Francuzów w Wojnie Francusko-Indiańskiej (1754-63), Indianie na zachód od Appalachów znaleźli się w sytuacji, w której ich przetrwanie było zagrożone, ponieważ nie mogli już dłużej rozgrywać Francuzów przeciwko Anglikom. Zdając sobie sprawę, że obecność tylko jednej europejskiej potęgi w ich sąsiedztwie oznacza, że stary system handlu załamał się, w 1763 roku wódz Ottawów Pontiac zjednoczył wiele grup wcześniej sprzymierzonych z Francuzami w celu wyparcia Anglików z doliny Ohio. Rebelia Pontiaca (1763-66), choć stosunkowo udana w cementowaniu sojuszu panindiańskiego, ostatecznie zakończyła się niepowodzeniem. Rząd angielski próbował osiągnąć pokój w 1763 r. poprzez królewską proklamację rozdzielającą Indian i angielskich osadników na szczycie Appalachów. Podczas gdy obietnica proklamacji, że cała ziemia na zachód od Appalachów będzie zarezerwowana dla Indian, osłabiła sojusz Pontiaca, nie zrobiła nic, by zmniejszyć euro-amerykańskie naciski na ziemię Indian, ponieważ amerykańscy handlarze, squattersi i spekulanci napływali bez ograniczeń do doliny Ohio.
Przez całą epokę kolonialną, europejska rywalizacja imperialna nakładała się na działania wojenne między Europejczykami a rdzennymi Amerykanami. Na przykład podczas wojen króla Wilhelma (1689-97), królowej Anny (1702-13) i króla Jerzego (1744-48) Francuzi wspierali najazdy Algonkinów na kolonie angielskie, a udomowieni Indianie z Nowej Anglii i niektórzy sprzymierzeńcy Irokezów pomagali Anglikom. W wojnie francusko-indiańskiej Francuzi i ich głównie algonkińscy sojusznicy poczynili początkowo imponujące postępy w kontrolowaniu doliny Ohio, począwszy od klęski Braddocka (1755), ale zostali pokonani przez liczniejszych Anglików i ich irokeskich popleczników. Indianie walczyli jako europejscy sprzymierzeńcy w tych wojnach, aby rozwijać swoje własne interesy związane z pozyskiwaniem broni i innych towarów handlowych oraz jeńców w celu adopcji, uzyskania statusu lub zemsty. Do końca Wojny Francuskiej i Indiańskiej, Indianom udawało się wykorzystywać te imperialne rywalizacje do zachowania swobody działania.
Wojna Rewolucyjna, jednakże, zmusiła Indian z Eastern Woodlands do radzenia sobie ze Stanami Zjednoczonymi, które przez Traktat Paryski (1783) nabyły wszystkie brytyjskie roszczenia na południe od Wielkich Jezior i na wschód od Missisipi. Stany Zjednoczone zachęcały do osiedlania się na nowo nabytych ziemiach, a wynikająca z tego euro-amerykańska presja na ziemie Indian spowodowała sporadyczne walki na Starym Północnym Zachodzie. Pod koniec lat osiemdziesiątych XVII wieku Shawnees i inni Indianie przypuścili ataki, które przetoczyły się przez Indianę, Ohio i zachodnią Pensylwanię, i dotkliwie pokonali oddziały armii amerykańskiej w 1790 („Klęska Harmara”) i 1791 roku („Klęska St. Claira”, w której 1400 Amerykanów pod dowództwem Arthura St. Claira poniosło 900 ofiar). Dopiero w 1794 roku wojskom amerykańskim udało się rozprawić z indiańskimi wojownikami w bitwie pod Fallen Timbers, w której gen. Anthony Wayne zdecydowanie pokonał Indian, zabezpieczając na razie Stary Północny Zachód pod kontrolą Europejczyków.
Po klęsce w 1794 r. i traktacie z Greenville (1795) baza ziemska Indian nadal się kurczyła aż do 1809 r., kiedy to bracia Shawnee, Tecumseh i Tenskwatawa, propagowali przesłanie jedności indiańskiej i natywizmu wśród plemion Starego Północnego Zachodu. Napięcie w regionie osiągnęło punkt kulminacyjny, gdy Indianie wykorzystali wojnę 1812 roku między Stanami Zjednoczonymi a Anglią do prowadzenia własnej wojny. Pomimo kilku początkowych zwycięstw na polu bitwy, te indiańskie wysiłki nie zdołały zrobić nic więcej, niż tylko na krótko opóźnić zakończenie amerykańskiego panowania na Starym Północnym Zachodzie. Ostatnia próba Indian zakończyła się niepowodzeniem w wojnie Czarnego Jastrzębia (1832).
Na południu różnorodni przywódcy Creeków zjednoczyli się, by rzucić wyzwanie białej inwazji. Mimo że niektórzy Creekowie opowiadali się za zakwaterowaniem, ich głosy pozostały bez echa, ponieważ biali z Georgii, Alabamy, Kentucky i Tennessee, ostatni pod przywództwem Andrew Jacksona, szukali ziemi i zemsty za rzekome okrucieństwa Creeków. Wynikająca z tego wojna Creeków (1811-14) zakończyła się bitwą pod Horseshoe Bend w Alabamie, w której zginęło 800 Indian, co było największą stratą w bitwie indiańskiej w historii USA. Czirokezi zostali wypędzeni na zachód w ramach Szlaku Łez (1838-39). Większość Indian z Florydy została podbita i wypędzona na zachód w wojnach seminolskich (1818; 1835-42; 1855-58). Podobnie jak Indianie na Starym Północnym Zachodzie, Indianie z Południa ulegli ekspansji USA.
Pokój, przerywany tylko okresowym zbrojnym oporem wobec polityki usuwania, trwał do końca wojny meksykańskiej w 1848 roku. Po tym konflikcie, rząd USA i Indianie na zachód od rzeki Mississipi stanęli w obliczu nowej fali migracji na zachód, napędzanej przez odkrycia złota w Kalifornii. Liczni, ale zatomizowani Indianie kalifornijscy musieli stawić czoło nie wojskom federalnym, lecz lokalnym oddziałom milicji i policji. Rezultat był druzgocący; jeśli gdziekolwiek na kontynencie Euroamerykanie dopuszczali się ludobójstwa na rdzennych Amerykanach, to właśnie w Kalifornii. W latach 1850-1860 wojna, choroby i głód zmniejszyły populację Indian kalifornijskich ze 150 000 do 35 000. Kiedy poszukiwacze znaleźli złoto w północno-zachodniej części Pacyfiku, w regionie tym wybuchły działania wojenne. Armia amerykańska zaangażowała się w wojny nad rzeką Rogue (1855-56), Yakima (1855-56) i Spokane (1858), by zmusić wiele plemion do utworzenia rezerwatów we wschodnich częściach Oregonu i Waszyngtonu. Modocowie i Nez Percé stawili najbardziej zdecydowany opór na północno-zachodnim Pacyfiku. Ci pierwsi, pod wodzą Keintpoosa, ukryli się na obszarze dziesięciu mil kwadratowych złóż lawy, na którym znajdowały się jaskinie i okopy. Z tej dogodnej pozycji 60 wojowników Modoców przez siedem miesięcy 1873 roku powstrzymywało 1000 żołnierzy federalnych. Kiedy Modocowie w końcu się poddali, Stany Zjednoczone dokonały egzekucji czterech ich przywódców, a pozostałych wysłały na Terytorium Indiańskie. Nez Percé, pod wodzą Wodza Józefa, poprowadzili armię przez ponad 1500 mil nierównego terytorium w Idaho, Wyoming i Montanie, aż większość z nich została schwytana na krótko przed próbą przekroczenia granicy kanadyjskiej w 1877 roku.
Początkowo Stany Zjednoczone starały się chronić szlaki lądowe prowadzące na zachodnie wybrzeże przed możliwymi atakami Indian. Chociaż ataki te były minimalne w latach czterdziestych XIX wieku, Indianie wcześnie odczuli obecność migrantów, ponieważ przynieśli oni choroby i przetrzebili zwierzynę wzdłuż szlaków. Takie reperkusje spowodowały eskalację napięć. Traktat z Fort Laramie, podpisany przez Stany Zjednoczone w 1851 roku, miał na celu zachowanie pokoju na równinach poprzez ograniczenie plemion do wyznaczonych ziem. Jednak walki wybuchły, gdy strony w dużej mierze zignorowały warunki traktatu, a migracja Amerykanów nadal wywierała szkodliwy wpływ na stada bizonów, od których Indianie z Równin uzależnieni byli w kwestii utrzymania. Chociaż migracja Amerykanów na zachód tymczasowo ustała podczas wojny secesyjnej, napięcia między Indianami a osadnikami pozostały wysokie. W Minnesocie grupy wschodnich Siuksów napadały na amerykańskie osady w 1862 roku, spotykając się z odwetem amerykańskich wojsk, które zepchnęły wielu z nich na równiny. Siuksowie ci stawili czoła stosunkowo zdyscyplinowanym oddziałom amerykańskim i poradzili sobie znacznie lepiej niż Czejenowie i Arapahowie z rąk ochotniczej milicji z Kolorado. Sporadyczne najazdy Indian na podróżujących Santa Fe Trail doprowadziły do tego, że w Kolorado zaczęto się obawiać wojny indiańskiej na szeroką skalę. Mając nadzieję na wyprzedzające uderzenie, John Chivington poprowadził ochotników z Denver do wymordowania większości bandy Czejenów Czarnego Czajnika oraz kilku południowych Arapahos w pobliżu Sand Creek – miejsca w południowo-wschodnim Kolorado, gdzie rząd USA obiecał im bezpieczeństwo. Masakra w Sand Creek (1864) spowodowała zemstę Czejenów i Arapaho, którzy przyłączyli się do Siuksów w sporadycznej dwudziestoletniej wojnie przeciwko Stanom Zjednoczonym. W wojnach Indian z Równin (1854-90) żołnierze amerykańscy prowadzili wojnę o otwarcie równin dla bezpiecznej podróży i osadnictwa, zamykając Indian w rezerwatach; wojownicy Indian z Równin dążyli do podniesienia indywidualnego statusu poprzez wojenne akty odwagi i zachowanie swojego sposobu życia. Indianie Równin stanęli teraz w obliczu ogromnej liczby Euroamerykanów, ponieważ rozwój kolei zapewnił białym żołnierzom i osadnikom skuteczny i ekonomiczny transport do spornego terytorium. W końcu Stany Zjednoczone zniszczyły główne źródło pożywienia Indian – bizony – w połączeniu z uporczywymi atakami na indiańskie wioski, co doprowadziło do upadku Indian na równinach. Na północy wojownicy wodza Oglala Czerwonej Chmury zatrzymali budowę Szlaku Bozemana między Fort Laramie a zachodnią Montaną (1866-67). W 1868 r. Siuksowie otrzymali amerykańskie gwarancje traktatowe dotyczące ich terytorium, w tym Czarnych Wzgórz w Dakocie Południowej. Jednak na północnych równinach zwycięstwa te okazały się krótkotrwałe. Odkrycie złota w Black Hills w latach 70. XIX wieku doprowadziło do nowej presji białych na ziemię Siuksów, ponieważ Stany Zjednoczone nie dotrzymały warunków traktatu z Fort Laramie z 1868 roku. Wojownicy Crow i Shoshone wspomagali amerykańskich żołnierzy w ich wysiłkach zmierzających do podboju i pacyfikacji kraju Siuksów. Zdeterminowana, by pomścić zagładę George’a Armstronga Custera i znacznej części Siódmej Kawalerii w bitwie nad Little Bighorn w 1876 roku, armia wytrwała do czasu, aż poddali się ostatni Indianie z północnych Równin. W 1877 roku zbrojny opór Siuksów praktycznie dobiegł końca, gdy wódz Siedzący Byk uciekł do Kanady, a Szalony Koń poddał się.
Na południowych równinach Kiowa, Komancze i południowi Czejenowie stanęli w obliczu podobnego losu. Osaczeni przez Teksańczyków na południu i osadników wzdłuż rzeki Platte na północy, na mocy traktatu Medicine Lodge w 1867 roku, Indianie ci zgodzili się żyć w rezerwatach w zamian za ochronę i zaopatrzenie ze strony rządu federalnego. Kiedy rząd federalny nie zapewnił obiecanych dostaw, Indianie opuścili rezerwaty, by polować i dokonywać najazdów. Gen. Philip H. Sheridan i inni oficerowie wzięli odwet rozpoczynając w 1868 roku zimowe kampanie przeciwko indiańskim wioskom w tym regionie. Działania wojenne trwały do roku 1875, kiedy to prawie wszyscy Indianie z południowych Równin podporządkowali się życiu w rezerwatach. Ostateczne rozstrzygnięcie nastąpiło w tragedii znanej jako bitwa pod Wounded Knee (1890).
Na amerykańskim Południowym Zachodzie, ostatnim regionie Stanów Zjednoczonych, który stanął w obliczu intensywnego euroamerykańskiego nacisku na ziemię, różne grupy Apaczów pod wodzą takich wybitnych przywódców jak Cochise, Victorio i Geronimo stawiały prawdopodobnie najbardziej długotrwały opór militarny Indian wobec euroamerykańskiej ekspansji. W przeciwieństwie do pobliskich Navajo, których bardziej osiadły tryb życia pomógł im zmusić się do kapitulacji w latach sześćdziesiątych XIX wieku, perspektywa poddania się wojskom amerykańskim postawiła Apaczów w obliczu katastrofalnej zmiany stylu życia. Co więcej, Apacze zamieszkiwali bardziej surowe terytorium niż Navajo, a ich bardziej koczowniczy tryb życia ułatwiał im przekraczanie i ponowne przekraczanie granicy meksykańskiej, gdy uciekali przed wojskami amerykańskimi. Opór Apaczów dobiegł końca w 1886 roku dopiero wtedy, gdy armia wysłała w ten region tysiące żołnierzy i pozwoliła im przekroczyć granicę meksykańską w pogoni za Apaczami.