Zabiegi mezoterapii są wykonywane w całej Europie, Ameryce Południowej, a ostatnio w Stanach Zjednoczonych od ponad pięćdziesięciu lat. Jednak lekarze wyrazili obawy co do skuteczności mezoterapii, twierdząc, że zabieg nie został przebadany na tyle, aby można było podjąć decyzję. Podstawowym problemem jest to, że mezoterapia w leczeniu warunków kosmetycznych nie była przedmiotem badań klinicznych o złotym standardzie; jednak procedura została przebadana pod kątem łagodzenia bólu w innych dolegliwościach, takich jak zapalenie ścięgien, zwapnienie ścięgien, zabiegi stomatologiczne, rak, cervicobrachialgia, zapalenie stawów, obrzęk limfatyczny i zastój żylny. Further, there have been case series and numerous medical papers on the mesotherapy as a cosmetic treatment, as well as studies that employ the ingredients used in mesotherapy.
The other side of the debate is expressed by Rod Rohrich, M.D., Chairman, Dept. of Plastic Surgery, University of Texas Southwestern Medical Center, Dallas: „Nie ma po prostu żadnych danych, żadnej nauki i żadnych informacji, według mojej wiedzy, że mezoterapia działa”. American Society of Plastic Surgeons wydało oświadczenie o stanowisku nie popierającym mezoterapii, ale ten brak poparcia jest przedmiotem pewnych kontrowersji. Ponieważ mezoterapia nie jest leczeniem chirurgicznym, ale raczej nieinwazyjną alternatywą dla chirurgii plastycznej, leczenie konkuruje z chirurgią plastyczną dla tych samych pacjentów.
FDA nie może kontrolować stosowania praktyków wstrzykujących różne mieszanki do ciał pacjentów, ponieważ ta praktyka podlega jurysdykcji państwowych rad medycznych. Dzieje się tak, ponieważ mezoterapia jest uważana za „procedurę” przez państwowe rady medyczne. FDA, z drugiej strony, jest upoważniona do zatwierdzania żywności, suplementów diety, leków, szczepionek, biologicznych produktów medycznych, produktów krwiopochodnych, urządzeń medycznych, urządzeń emitujących promieniowanie, produktów weterynaryjnych i kosmetyków.
Robin Ashinoff, przemawiając w imieniu American Academy of Dermatology, mówi „Prosty zastrzyk daje ludziom fałszywą nadzieję. Wszyscy szukają szybkiego rozwiązania. Ale nie ma szybkiej recepty na tłuszcz lub złogi tłuszczu lub na cellulit.” Amerykańskie Towarzystwo Chirurgii Dermatologicznej poinformowało swoich członków w lutym 2005 roku, że „dalsze badania są uzasadnione, zanim będzie można poprzeć tę technikę.”
Wielu dermatologów i chirurgów plastycznych jest zaniepokojonych rosnącym profilem mezoterapii. „Nikt nie mówi dokładnie, co wkłada do (strzykawki),” mówi Naomi Lawrence, derma-chirurg na Uniwersytecie Medycyny i Stomatologii w New Jersey. „Jeden lek, którego często używają, fosfatydylocholina, jest nieprzewidywalny i powoduje ekstremalny stan zapalny i obrzęk w miejscu wstrzyknięcia. To nie jest łagodny lek.”
To jest obecnie zakazane w wielu krajach Ameryki Południowej. Nawet Brazylia, która jest mniej rygorystyczna niż USA w zatwierdzaniu leków, zakazała stosowania leku do tych celów.
W Australii, salon terapii alternatywnej jest badany przez Departament Zdrowia po tym, jak kilku klientów rozwinęło ropnie skóry na łydkach, pośladkach, udach, brzuchu, ramionach, twarzy i szyi w wyniku leczenia, przy czym u jednego pacjenta rozwinęła się również infekcja prątkami gruźlicy.
W następstwie niepożądanych efektów zaobserwowanych u kilku pacjentów francuskiego lekarza, w kwietniu 2011 r. opublikowano we Francji oficjalną ratyfikację zakazu stosowania Mezoterapii jako metody usuwania złogów tłuszczu. Zakaz ten został odwołany w czerwcu 2011 r. przez francuską Radę Stanu, ponieważ dochodzenie wykazało, że te niepożądane efekty nie były spowodowane samą Mezoterapią, ale faktem, że była ona wykonywana w złych warunkach i bez przestrzegania zasad higieny.