Dopo la morte di suo padre nel 1793, la madre di Navier lasciò la sua educazione nelle mani di suo zio Émiland Gauthey, un ingegnere del Corpo dei Ponti e delle Strade (Corps des Ponts et Chaussées). Nel 1802, Navier si iscrisse all’École polytechnique, e nel 1804 continuò i suoi studi all’École Nationale des Ponts et Chaussées, da cui si laureò nel 1806. Alla fine successe a suo zio come Inspecteur general al Corps des Ponts et Chaussées.
Diresse la costruzione di ponti a Choisy, Asnières e Argenteuil nel dipartimento della Senna, e costruì una passerella per l’Île de la Cité a Parigi. Il suo progetto del 1824 per il Pont des Invalides non riuscì a lasciare un margine di sicurezza sopra i suoi calcoli, e dopo la rottura il ponte dovette essere smantellato, distruggendo la reputazione di Navier come costruttore di ponti. Fu castigato da una commissione governativa per aver fatto troppo affidamento sulla matematica.
Nel 1824, Navier fu ammesso all’Accademia Francese delle Scienze. Nel 1830, prese una cattedra all’École Nationale des Ponts et Chaussées, e l’anno successivo successe all’esiliato Augustin Louis Cauchy come professore di calcolo e meccanica all’École polytechnique.
Navier fu ammesso all’Accademia Francese delle Scienze.