Les types de pathogenèse comprennent l’infection microbienne, l’inflammation, la malignité et la dégradation des tissus. Par exemple, la pathogenèse bactérienne est le mécanisme par lequel les bactéries provoquent une maladie infectieuse.
La plupart des maladies sont causées par des processus multiples. Par exemple, certains cancers découlent d’un dysfonctionnement du système immunitaire (tumeurs cutanées et lymphomes après une transplantation rénale, qui nécessite une immunosuppression).
Les mécanismes pathogéniques d’une maladie (ou d’une affection) sont mis en branle par des causes étiologiques sous-jacentes, dont le contrôle permettrait de prévenir la maladie. Souvent, une étiologie potentielle est identifiée par des observations épidémiologiques avant qu’un lien pathologique puisse être établi entre cette cause et la maladie. La perspective pathologique peut être directement intégrée à une approche épidémiologique dans le domaine interdisciplinaire de l’épidémiologie pathologique moléculaire (EPM). L’EPM peut aider à évaluer la pathogenèse et la causalité en reliant un facteur étiologique potentiel aux signatures pathologiques moléculaires d’une maladie.