Lynch a travaillé avec Todd English (à partir de 1989) pendant plusieurs années avant de partir en tournée en Italie. À son retour à Boston, elle a été nommée chef exécutif de la trattoria Galleria Italiana, et a ensuite remporté le prix des « Dix meilleurs nouveaux chefs d’Amérique » de Food &Vine.
En 1998, elle a ouvert son premier restaurant, No. 9 Park, près du Boston Common et de la Massachusetts State House.
Son entreprise Barbara Lynch Gruppo compte aujourd’hui 220 employés et réalise des recettes d’environ 20 millions de dollars par an. Elle supervise une société de restauration et plusieurs restaurants populaires : No. 9 Park (un standard Brahmin Beacon Hill), Sportello (un lieu de rendez-vous pour les pâtes), Drink (un bar à cocktails artisanaux), B&G Oysters (un restaurant de fruits de mer), the Butcher Shop (un comptoir de viande et un café), Menton (un établissement de restauration fine) et Stir (une cuisine de démonstration ouverte où elle donne des cours). Le Barbara Lynch Gruppo comprend les restaurants de Boston No. 9 Park, B&G Oysters et Menton (nommé en mars 2014 l’un des 10 meilleurs endroits pour les gourmands à Boston par USA Today).